Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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Rab11fip1Q9D620 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rab11fip1Q9D620 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rab11fip1Q9D620 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Rab11fip1Q9D620 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip1Q9D620 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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