Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mis18aQ9CZJ6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms