Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rab5aQ9CQD1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rab5aQ9CQD1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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