Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trps1Q925H1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trps1Q925H1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trps1Q925H1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trps1Q925H1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trps1Q925H1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trps1Q925H1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trps1Q925H1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trps1Q925H1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trps1Q925H1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trps1Q925H1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trps1Q925H1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trps1Q925H1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Trps1Q925H1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Trps1Q925H1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trps1Q925H1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trps1Q925H1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trps1Q925H1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trps1Q925H1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms