Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctdsp2Q8BX07 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctdsp2Q8BX07 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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