Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms