Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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