Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA9Q13797 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms