Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms