Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a2P20490 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms