Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms