Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RGPD2P0DJD1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGPD2P0DJD1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms