Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP4

Serpinb6c, Serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb6cW4VSP4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Serpinb6cW4VSP4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serpinb6cW4VSP4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Serpinb6cW4VSP4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Serpinb6cW4VSP4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Serpinb6cW4VSP4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms