Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Hmg20bQ9Z104 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hmg20bQ9Z104 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hmg20bQ9Z104 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms