Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn3Q9Z0G9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn3Q9Z0G9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms