Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Cyp46a1Q9WVK8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Cyp46a1Q9WVK8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Cyp46a1Q9WVK8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Cyp46a1Q9WVK8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Cyp46a1Q9WVK8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,92
Cyp46a1Q9WVK8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Cyp46a1Q9WVK8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Cyp46a1Q9WVK8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Cyp46a1Q9WVK8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Cyp46a1Q9WVK8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Cyp46a1Q9WVK8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Cyp46a1Q9WVK8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Cyp46a1Q9WVK8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Cyp46a1Q9WVK8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Cyp46a1Q9WVK8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Cyp46a1Q9WVK8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Cyp46a1Q9WVK8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Cyp46a1Q9WVK8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Cyp46a1Q9WVK8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Cyp46a1Q9WVK8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,3 ms