Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mixl1Q9WUI0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mixl1Q9WUI0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mixl1Q9WUI0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mixl1Q9WUI0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mixl1Q9WUI0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mixl1Q9WUI0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mixl1Q9WUI0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mixl1Q9WUI0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mixl1Q9WUI0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mixl1Q9WUI0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms