Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU62

Incenp, Inner centromere protein, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IncenpQ9WU62 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IncenpQ9WU62 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IncenpQ9WU62 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IncenpQ9WU62 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IncenpQ9WU62 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IncenpQ9WU62 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IncenpQ9WU62 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IncenpQ9WU62 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IncenpQ9WU62 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IncenpQ9WU62 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IncenpQ9WU62 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms