Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AtrnQ9WU60 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AtrnQ9WU60 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AtrnQ9WU60 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AtrnQ9WU60 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AtrnQ9WU60 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AtrnQ9WU60 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AtrnQ9WU60 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AtrnQ9WU60 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AtrnQ9WU60 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AtrnQ9WU60 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AtrnQ9WU60 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AtrnQ9WU60 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AtrnQ9WU60 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AtrnQ9WU60 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
AtrnQ9WU60 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AtrnQ9WU60 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AtrnQ9WU60 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AtrnQ9WU60 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AtrnQ9WU60 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AtrnQ9WU60 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AtrnQ9WU60 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AtrnQ9WU60 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AtrnQ9WU60 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
AtrnQ9WU60 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AtrnQ9WU60 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AtrnQ9WU60 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AtrnQ9WU60 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms