Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptpn4Q9WU22 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn4Q9WU22 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn4Q9WU22 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn4Q9WU22 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms