Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vax2Q9WTP9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vax2Q9WTP9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vax2Q9WTP9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms