Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzd4Q9QY39 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pdzd4Q9QY39 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdzd4Q9QY39 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzd4Q9QY39 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms