Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfx5Q9JL61 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx5Q9JL61 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx5Q9JL61 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx5Q9JL61 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx5Q9JL61 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx5Q9JL61 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx5Q9JL61 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx5Q9JL61 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx5Q9JL61 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfx5Q9JL61 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfx5Q9JL61 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfx5Q9JL61 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfx5Q9JL61 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfx5Q9JL61 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfx5Q9JL61 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfx5Q9JL61 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx5Q9JL61 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx5Q9JL61 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx5Q9JL61 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx5Q9JL61 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx5Q9JL61 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms