Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc5a3Q9JKZ2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc5a3Q9JKZ2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc5a3Q9JKZ2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms