Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx5Q9JKQ4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx5Q9JKQ4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx5Q9JKQ4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms