Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl39Q9JKF7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl39Q9JKF7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms