Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nectin1Q9JKF6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nectin1Q9JKF6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nectin1Q9JKF6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms