Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lmbr1Q9JIT0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmbr1Q9JIT0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.8 ms