Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIE3

Otor, Otoraplin, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtorQ9JIE3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OtorQ9JIE3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms