Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ParvbQ9ES46 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ParvbQ9ES46 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ParvbQ9ES46 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ParvbQ9ES46 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ParvbQ9ES46 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ParvbQ9ES46 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ParvbQ9ES46 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ParvbQ9ES46 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ParvbQ9ES46 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ParvbQ9ES46 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ParvbQ9ES46 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ParvbQ9ES46 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ParvbQ9ES46 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ParvbQ9ES46 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ParvbQ9ES46 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ParvbQ9ES46 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ParvbQ9ES46 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ParvbQ9ES46 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms