Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dap3Q9ER88 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dap3Q9ER88 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dap3Q9ER88 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms