Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chst1Q9EQC0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chst1Q9EQC0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chst1Q9EQC0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chst1Q9EQC0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms