Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clstn1Q9EPL2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clstn1Q9EPL2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms