Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC29

Abcb6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb6Q9DC29 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcb6Q9DC29 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Abcb6Q9DC29 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcb6Q9DC29 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb6Q9DC29 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb6Q9DC29 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb6Q9DC29 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb6Q9DC29 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb6Q9DC29 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb6Q9DC29 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms