Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chmp2aQ9DB34 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp2aQ9DB34 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp2aQ9DB34 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms