Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB24

Tceal6, Transcription elongation factor A (SII)-like 6, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tceal6Q9DB24 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tceal6Q9DB24 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tceal6Q9DB24 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tceal6Q9DB24 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tceal6Q9DB24 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tceal6Q9DB24 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tceal6Q9DB24 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tceal6Q9DB24 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tceal6Q9DB24 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tceal6Q9DB24 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tceal6Q9DB24 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tceal6Q9DB24 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tceal6Q9DB24 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tceal6Q9DB24 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tceal6Q9DB24 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tceal6Q9DB24 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tceal6Q9DB24 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tceal6Q9DB24 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms