Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc54Q9DAL3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc54Q9DAL3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms