Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp12Q9D9M2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp12Q9D9M2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp12Q9D9M2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp12Q9D9M2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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