Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx5Q9D8U8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx5Q9D8U8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx5Q9D8U8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx5Q9D8U8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms