Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tube1Q9D6T1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tube1Q9D6T1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms