Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W6

Slco6d1, MCG6225, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco6d1Q9D5W6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slco6d1Q9D5W6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slco6d1Q9D5W6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slco6d1Q9D5W6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slco6d1Q9D5W6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slco6d1Q9D5W6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slco6d1Q9D5W6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slco6d1Q9D5W6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slco6d1Q9D5W6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms