Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C5

Eaf1, ELL-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eaf1Q9D4C5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Eaf1Q9D4C5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eaf1Q9D4C5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eaf1Q9D4C5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eaf1Q9D4C5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eaf1Q9D4C5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms