Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Odf2lQ9D478 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Odf2lQ9D478 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Odf2lQ9D478 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Odf2lQ9D478 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Odf2lQ9D478 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Odf2lQ9D478 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Odf2lQ9D478 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Odf2lQ9D478 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Odf2lQ9D478 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Odf2lQ9D478 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Odf2lQ9D478 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Odf2lQ9D478 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Odf2lQ9D478 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Odf2lQ9D478 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Odf2lQ9D478 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms