Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps33aQ9D2N9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps33aQ9D2N9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vps33aQ9D2N9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps33aQ9D2N9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps33aQ9D2N9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 367.7 ms