Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ribc1Q9D0B8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ribc1Q9D0B8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ribc1Q9D0B8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms