Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nsfl1cQ9CZ44 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nsfl1cQ9CZ44 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nsfl1cQ9CZ44 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nsfl1cQ9CZ44 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nsfl1cQ9CZ44 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms