Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssu72Q9CY97 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssu72Q9CY97 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssu72Q9CY97 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms