Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmem50aQ9CXL1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem50aQ9CXL1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem50aQ9CXL1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem50aQ9CXL1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem50aQ9CXL1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem50aQ9CXL1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem50aQ9CXL1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem50aQ9CXL1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem50aQ9CXL1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem50aQ9CXL1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem50aQ9CXL1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem50aQ9CXL1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem50aQ9CXL1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms