Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpusd4Q9CWX4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms