Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
2310003L06RikQ9CV82 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
2310003L06RikQ9CV82 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
2310003L06RikQ9CV82 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
2310003L06RikQ9CV82 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
2310003L06RikQ9CV82 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
2310003L06RikQ9CV82 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
2310003L06RikQ9CV82 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
2310003L06RikQ9CV82 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
2310003L06RikQ9CV82 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
2310003L06RikQ9CV82 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
2310003L06RikQ9CV82 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
2310003L06RikQ9CV82 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2310003L06RikQ9CV82 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2310003L06RikQ9CV82 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2310003L06RikQ9CV82 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2310003L06RikQ9CV82 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
2310003L06RikQ9CV82 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
2310003L06RikQ9CV82 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms